The DigiRhythm Library

digirhythm
L'actogramme (en haut à gauche) de la sortie de l'accéléromètre d'une vache, le degré de couplage fonctionnel et la puissance harmonique (en haut à droite) et l'activité moyenne (en bas à gauche) calculés et visualisés en utilisant la bibliothèque DigiRhythm.

Les animaux présentent des activités rythmiques appelées activités «circadiennes». Le suivi et l'étude de ces rythmes donnent une idée du bien-être des animaux. Plus la rythmicité est importante, plus le bien-être des animaux est élevé.

Le calcul de ces rythmes est basé sur le degré de couplage fonctionnel (DFC), une quantité qui est calculée à partir de spectres de fréquence de l'activité des animaux.

A cet effet, nous avons créé DigiRhythm, une bibliothèque R qui aide les chercheuses et chercheurs à calculer la rythmicité. La bibliothèque offre entre autres de nombreux algorithmes et visualisations liés:

  • au degré de couplage fonctionnel
  • à la puissance harmonique
  • à l’activité moyenne
  • à l’indice de diurnité
  • aux actogrammes.

Vous pouvez télécharger la bibliothèque à partir du lien Github Link. Celle-ci sera bientôt introduite dans le CRAN repository.

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