Mycologie viticulture et grandes cultures

Mildiou sur vigne

Axes de recherche

Diagnostics et renseignements
L'identification des pathogènes fongiques est indispensable à la définition d'une stratégie de lutte appropriée. Un grand nombre de demandes de renseignements concernant les cultures traditionnelles et émergentes nous parviennent régulièrement. Ces diagnostics, essentiels à nos partenaires, nécessitent notre expertise et notre appui scientifique.

Epidémiologie et étiologie
Caractériser la communauté fongique associée à la plante hôte est essentielle pour comprendre l'équilibre entre les champignons et leur hôte et comment se développe la maladie. Cette caractérisation et le diagnostic impliquent le développement d'outils moléculaires qui permettent de quantifier la présence d'un champignon pathogène, de suivre son évolution dans la plante et d'identifier les hôtes possibles.

Outils d'aide à la décision et prévision des risques
La lutte contre les maladies fongiques est liée à l'application de fongicides à intervalles plus ou moins réguliers. L'étude des conditions requises pour le développement des pathogènes permet de modéliser l'épidémie afin d'appliquer les fongicides au moment opportun. Agrometeo est une plate-forme qui rassemble des données microclimatiques, des outils d'aide à la décision et des informations pour une meilleure gestion de la lutte phytosanitaire.

Fongicides : stratégies de lutte, techniques d'application et résistance
L'efficacité de la lutte fongicide se base sur une bonne connaissance des matières actives, un dosage précis et une bonne technique d'application, notamment dans le cadre de l'homologation des fongicides. Le sur- ou le sous-dosage des fongicides peuvent avoir des conséquences sur la qualité de la protection, sur l'environnement et augmenter les risques de résistance des pathogènes ou de résidus dans le produit fini.

Sensibilité variétale et aide à la sélection
Au cours de l'évolution, les plantes ont développé des mécanismes naturels pour résister aux infections. L'utilisation de ces mécanismes de résistance permet d'éviter ou de réduire le recours aux fongicides et contribue ainsi à ménager l'environnement tout en assurant une récolte de qualité. Ces mécanismes peuvent être intégrés au niveau de la création ou de l'étude variétale.

Métabolomique
Le métabolome est constitué par l'ensemble des métabolites contenus dans un organisme à un moment et dans une situation donnés. Cet ensemble de molécules résulte des interactions complexes entre le protéome et le génome de l'organisme ainsi que son environnement. Les empreintes métaboliques permettent de mettre en évidence les principaux changements intervenus en cas de stress. Cette méthode permet aussi de découvrir de nouvelles molécules bioactives.

Responsable

Projet de recherche

Interactions plantes-champignons

Interactions plantes-champignons, pronostic des risques et lutte

Les maladies fongiques en lien avec les changements climatiques et les pratiques agronomiques sont des problèmes récurrents contre lesquelles de nouvelles solutions doivent être trouvées.

Liens

Le groupe de mycologie de Changins maintient en culture plus de 1'000 espèces de champignons pathogènes, saprophytes ou endophytes, de même qu'environ 600 spécimens d'herbiers représentatifs de la biodiversité suisse

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