Batteri e fungi fitopatogeni, tra i quali organismi di quarantena, arrecano grossi danni in frutti- e orticultura. Per l'identificazione precoce di questi microorganismi, le tecniche microbiologiche classiche sono combinate a tecniche diagnostiche moderne, quali PCR, LAMP o MALDI-TOF. Queste tecniche sono costantemente aggiornate ed ottimizzate nei nostri laboratori e vengono applicate per la diagnosi di organismi di quarantena in frutti- e orticultura a supporto del servizio fitosanitario federale (SFF).
Lo studio dell'interazione tra patogeno e pianta ospite, cosi come aspetti epidemiologici forniscono informazioni importanti allo sviluppo di strategie e di raccomandazioni pratiche di lotta. Tra le malattie che minacciano la produzione frutticola, la priorità è data al fuoco batterico, una malattia di quarantena.