Pubblicazioni

Christian Ahrens

Christian Ahrens

Picture

Bioinformatiker
Dr.

Forschungsgruppe

  • 22.00.13.10 Molekulare Ökologie

Organisatorische Einheit

Kompetenzbereich Methodenentwicklung und Analytik (MEA)

Christian Ahrens

Agroscope
Reckenholzstrasse 191
8046 Zürich
Schweiz

Tel. +41 58 460 61 14

Standort Reckenholz

Christian Ahrens

Tätigkeiten

Analyse von Mikrobiomen und funktionell besonders relevanter Isolate unter dem Leitsatz «Vom Genom zur Funktion»

Portfolio: Bioinformatische Analyse und Integration von Daten die mittels Methoden der funktionellen Genomik (zB Genomsequenzierung, Transkriptom-, Proteom-, Metabolomanalysen) erhoben wurden; Einbezug der vergleichenden Genomik. Mitarbeit in nationalen und internationalen Konsortien (u.a. bei der Kompostmikrobiomanalyse; Identifizierung und Charakterisierung von Biocontrolstämmen zur Reduktion Einsatz Pflanzenschutzmittel sowie Förderung Pflanzenwachstum). Synergie mit Drittmittelforschung: Entwicklung integrierter Systeme zur Erforschung von Antibiotikaresistenz und Biofilmbildung; Entwicklung von Methoden zu verbesserten Genomannotation von Prokaryoten; Identifizierung neuer Biokontrollgene und antimikrobiell wirkender Peptide.

Thematischer Fokus: Prokaryoten, Biokontrolle, Plant growth promotion, Interaktion Pflanzen-Mikroorganismen, fermentierte Lebensmittel, Antibiotikaresistenz und Biofilmbildung

Methodischer Fokus: Assemblierung von Genomen (de novo), Synergie Genomik -Metagenomik, Transkriptomik, Proteomik, intergierte Datenanalyse, Entschlüsselung von Wirkmechanismen

Publikationsverzeichnisse

  1. Publons
  2. ResearchGate
  3. Google Scholar

 

Precedenti progetti

https://www.agroscope.admin.ch/content/agroscope/it/home/themen/arbeitsprogramme-alt/arbeitsprogramm-2014-2017/oekologische-intensivierung/schaedlingsprognose-ueberwachung-obst-gemuesebau/publikatiionen.exturl.html/aHR0cHM6Ly9pcmEuYWdyb3Njb3BlLmNoL2RlLUNIL1BhZ2UvTW/l0YXJiZWl0ZXI_YWdyb3Njb3BlSWQ9NzY3Nw==.html