Le commerce mondial de matériel végétal peut entraîner la propagation d'organismes nuisibles particulièrement dangereux, appelés organismes de quarantaine, ainsi que de nouveaux organismes nuisibles encore inconnus. Une ordonnance met en place une procédure pour empêcher que ces organismes ne s’établissent en Suisse. L'expertise et l'infrastructure d'Agroscope, qui offrent les capacités de laboratoire nécessaires, constituent la base des travaux d’exécution de l'Office fédéral de l'agriculture.