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Boden ist ein Habitat, das eine grosse Vielfalt an Mikroorganismen, d. h. Bakterien, Archaeen, Pilzen und Protisten, beherbergt. Wir wissen, dass diese Kleinstlebewesen für eine Vielzahl spezifischer Bodenfunktionen verantwortlich sind. Im Rahmen des Biodiversitätsmonitorings der Schweiz haben wir an 255 Standorten die Diversität der Bodenbakterien und -pilze untersucht. Insgesamt wurden 109 693 Bakterien- und 28 085 Pilztaxa gefunden, wobei etwa 2/3 der Bakterien- und 1/3 der Pilztaxa einer Gattung und der Rest nur einer höheren taxonomischen Klasse zugeordnet werden konnte. Die verschiedenen Landnutzungstypen unterschieden sich signifikant in Vielfalt und Struktur ihrer Bakterien- und Pilzgemeinschaften. Innerhalb des Waldes waren z. B. Pilzgemeinschaften signifikant vom Waldtyp und Bakteriengemeinschaften am stärksten vom pH des Bodens bestimmt. Unsere erste systematische Erhebung von Bakterien und Pilzen in Schweizer Böden zeigte eine immense und dem Lebensraum angepasste mikrobielle Diversität, deren umfassende funktionelle Bedeutung wir erst beginnen zu verstehen.