Microbiote
Petits organismes microscopiques (microorganismes; autrefois: microflore). Ce terme englobe les bactéries, les archées (Archaea), les virus, les protistes et les champignons [1].
Microflore
Utilisé autrefois à la place de microbiote. Le terme «flore» se réfère au règne végétal, il n’est plus guère utilisé aujourd’hui en relation avec les microorganismes.
Microbiome
Ensemble des microorganismes. Ce terme peut aussi se référer à un environnement spécifique (par exemple le microbiome du sol) ou à un échantillon spécifique (par exemple le microbiome d’un échantillon spécifique de sol).
Métagénome
Ensemble des informations génétiques contenues dans tous les génomes. Ce terme peut aussi se référer à un environnement spécifique (par exemple le métagénome du sol) ou à un échantillon spécifique (par exemple le métagénome d’un échantillon spécifique de sol).
Holobionte
Organisation biologique composée d’un organisme hôte (humain, animal ou plante) et de tous les organismes associés (par exemple le microbiome) [1].
Hologénome
Ensemble des informations génétiques de l’organisme hôte avec ses organismes associés (par exemple du microbiome) [1].
