L’agriculture biologique et à faible niveau d'intrants offre des habitats pour la flore et la faune. Des exemples frappants en sont le vautour moine dans les Dehesas en Espagne et les orchidées dans les prairies de montagne à gestion extensive. De plus, ces systèmes utilisent des races traditionnelles comme la race bovine Aubrac. Ainsi, elles contribuent considérablement maintenir la biodiversité en Europe.
L’objectif du projet de recherche BioBio (Indicateurs de biodiversité dans les systèmes d’agriculture biologique et ä faible niveau d’intrants, UE FP7, KBBE-227161, 2009-2012) était d’identifier une série d’indicateurs de biodiversité
- scientifiquement fondés
- génériques à l’échelle européenne
- pertinents et utiles pour les parties prenantes.