Responsable Microbiome du sol
Responsable Microbiome des plantes
Christian Ahrens
Bioinformatiker
Dr.
Forschungsgruppe
- 22.00.13.10 Molekulare Ökologie
Funktion
Teamleiter Mikrobielle Genomik und Bioinformatik
Steering Komitee Bioinformatik Netzwerk Agroscope (Wissenschaftliche Leitung)
Gruppenleiter Bioinformatik und Proteogenomik (SIB, Schweizer Institut für Bioinformatik)
Organisatorische Einheit
Kompetenzbereich Methodenentwicklung und Analytik (MEA)
Agroscope-ID: 7677 Per E-Mail versenden
Christian Ahrens
Christian Ahrens
Projekte
- 22.08.13.10.02
- 22.08.13.10.01
- 22.05.16.04.01
- 22.08.18.03.05
- 22.09.18.09.01
- 22.09.18.07.02
- 22.15.19.05.01
Publikationen
Christian Ahrens
Tätigkeiten
Analyse von Mikrobiomen und funktionell besonders relevanter Isolate unter dem Leitsatz «Vom Genom zur Funktion»
Portfolio: Bioinformatische Analyse und Integration von Daten die mittels Methoden der funktionellen Genomik (zB Genomsequenzierung, Transkriptom-, Proteom-, Metabolomanalysen) erhoben wurden; Einbezug der vergleichenden Genomik. Mitarbeit in nationalen und internationalen Konsortien (u.a. bei der Kompostmikrobiomanalyse; Identifizierung und Charakterisierung von Biocontrolstämmen zur Reduktion Einsatz Pflanzenschutzmittel sowie Förderung Pflanzenwachstum). Synergie mit Drittmittelforschung: Entwicklung integrierter Systeme zur Erforschung von Antibiotikaresistenz und Biofilmbildung; Entwicklung von Methoden zu verbesserten Genomannotation von Prokaryoten; Identifizierung neuer Biokontrollgene und antimikrobiell wirkender Peptide.
Thematischer Fokus: Prokaryoten, Biokontrolle, Plant growth promotion, Interaktion Pflanzen-Mikroorganismen, fermentierte Lebensmittel, Antibiotikaresistenz und Biofilmbildung
Methodischer Fokus: Assemblierung von Genomen (de novo), Synergie Genomik -Metagenomik, Transkriptomik, Proteomik, intergierte Datenanalyse, Entschlüsselung von Wirkmechanismen
Publikationsverzeichnisse
Responsable Microbiome des aliments fermentés
Responsable ANET-GB: Plateforme de bioinformatique
