Ressources génétiques fruitières

Lors de l'inventaire des fruits effectué dans toute la Suisse entre 2000 et 2005, environ 2500 anciennes variétés de fruits ont été répertoriées (pommes, poires, cerises et pruneaux). Depuis, celles-ci sont conservées et décrites par diverses organisations privées, notamment dans le cadre du PAN-RPGAA de l'OFAG (Plan d'action national pour la conservation et l'utilisation durable des ressources phytogénétiques pour l'alimentation et l'agriculture). De 2007 à 2023, Agroscope, ou plus précisément le groupe de recherche «Sélection et ressources génétiques des fruits» (nom actuel «Amélioration génétique des espèces fruitières»), a réalisé, sur mandat de l'association FRUCTUS, divers projets PAN-RPGAA de description et d'utilisation dans le domaine des ressources génétiques fruitières (entre autres BEVOG I-IV, NUVOG I et II). Depuis 2023, Agroscope continue à participer à des projets PAN en cours par le biais de mandats dans le domaine des tests de sensibilité aux maladies (BEVOG V, NUBIG).

Description des ressources génétiques fruitières

Depuis l'inventaire des fruits, les variétés répertoriées sont conservées dans de nombreuses collections de conservation réparties dans toute la Suisse. Des descriptions des fruits ont été réalisées ainsi que des descriptions photographiques. Celles-ci peuvent être consultées sur le système d'information national (voir les liens ci-dessous).

L'analyse par marqueurs moléculaires (SSR) a permis d'identifier et d'éliminer de nombreux doublons. Avec l'aide de pomologues (experts en variétés fruitières anciennes) et d'anciennes pomologies écrites, certaines incertitudes concernant l'identification et la dénomination des variétés ont été levées.

Outre les caractéristiques externes et internes des fruits, celles des arbres sont également d'un grand intérêt. La sensibilité des variétés à différentes maladies (tavelure, oïdium, feu bactérien, Marssonina) a été testée, en particulier dans le cas des ressources génétiques des pommes.

Actuellement, ces travaux se poursuivent dans le cadre du projet PAN « BEVOG V »(description des ressources génétiques fruitières) de FRUCTUS.

Utilisation des ressources génétiques fruitières

Tant la description des ressources génétiques fruitières que leur utilisation sont importantes.

Des projets axés sur l'utilisation ont permis d’étudier l'aptitude de diverses variétés anciennes pour la production d'eau-de-vie, de jus ou de cidre. Les résultats sont résumés dans des «apps Shiny», dans le guide des variétés de cidre et dans des fiches variétales (voir les liens ci-dessous).
Par ailleurs, dans le cadre des projets « NAGBA I et II » (utilisation des ressources génétiques des pommes pour la culture biologique) menés par le FiBL, Agroscope et Poma Culta, les variétés anciennes les plus prometteuses issues des projets de description ont été analysées quant à leur aptitude à la culture biologique et utilisées comme partenaires de croisement pour des programmes de sélection.

Actuellement, dans le cadre du projet PAN « NUBIG » deFRUCTUS (utilisation du pool de ressources génétiques des poires suisses), de nombreux paramètres (entre autres la sensibilité au feu bactérien et à la maladie des taches noires, les caractéristiques du jus) sont relevés sur un ensemble aussi diversifié que possible du point de vue génétique (155 accessions de la Swiss Pear Core Collection à Bözberg). L'un des objectifs est de trouver les segments de génome pertinents dans des étude d'association pangénomique. Dans le cadre du projet PAN « Swiss Apple Core Collection » (SACC) de l'ETH, de telles études sont également menées pour les ressources génétiques des pommes (voir les liens ci-dessous).

Collaboration

En Suisse, Agroscope collabore, dans le domaine des ressources génétiques fruitières, avec FRUCTUS, l'ETH et le FiBL. Agroscope est également en relation avec d'autres organisations et organismes nationaux et internationaux (entre autres CPC, JKI Dresden, ECPGR).