Arbeitspakete

Forschungsprogramm Mikrobielle Biodiversitaet Mikrobiom

Boden Mikrobiom

Im Arbeitspaket „Mikrobiom des Bodens" wird die Erforschung der mikrobiellen Biodiversität in verschiedenen für die Schweiz und die Landwirtschaft repräsentativen Böden und Systemen erfolgen, um das Zusammenspiel von Bodentyp, Bodennutzung...

Forschungsprogramm Mikrobielle Biodiversitaet Mikrobium

Pflanzen Mikrobiom

Im Arbeitspaket „Mikrobiom der Pflanze" wird die auf der Pflanzenoberfläche und in den Pflanzengeweben vorkommende mikrobielle Biodiversität von Raigras, Kartoffel und Apfel untersucht. Der Einfluss des natürlichen Mikrobioms auf den Schutz der Pflanze vor...

Forschungsprogramme Mikrobielle Biodiversitaet Lebensmittel

Fermentierte Lebensmittel Mikrobiom

Im Arbeitspaket „Mikrobiom fermentierter Lebensmittel" wird die Biodiversität, welche in der Agroscope Stammsammlung (Liebefeld, Wädenswil) repräsentiert ist und die des Ökosystems „Rohmilchkäse" analysiert, und die mikrobiellen und biochemischen Vorgänge...

ANET-GB: Bioinformatik Plattform

Im Arbeitspaket „Genomik und Bioinformatik" geht es um die Einrichtung eines Agroscope-weiten Experten-Netzwerkes und der entsprechenden Infrastruktur. Das Ziel ist es, Agroscope-Projekten die für die Datenaufarbeitung notwendige Infrastruktur zur...

Mikrobiota
Mikroskopisch kleine Lebewesen (Mikroorganismen; früher: Mikroflora). Der Begriff umfasst Bakterien, Archaeen, Viren, Protisten und Pilze [1].

Mikroflora
Früher anstelle von Mikrobiota verwendet. Da sich der Begriff "Flora" auf das Pflanzenreich bezieht, wird er heute im Zusammenhang mit Mikroorganismen kaum verwendet.

Mikrobiom
Gesamtheit der Mikroorganismen. Dieser Begriff kann sich auch auf einen bestimmten Lebensraum beziehen (z.B. Mikrobiom des Bodens) oder auf eine bestimmte Probe (z.B. Mikrobiom einer bestimmten Bodenprobe).

Metagenom
Gesamtheit der genetischen Information, welche in allen Genomen enthalten ist. Dieser Begriff kann sich auch auf einen bestimmten Lebensraum beziehen (z.B. Metagenom des Bodens) oder auf eine bestimmte Probe (z.B. Metagenom einer bestimmten Bodenprobe).

Holobiont
Eine biologische Organisation bestehend aus Wirtsorganismus (Mensch, Tier oder Pflanze) und allen assoziieren Organismen (z.B. das Mikrobiom)

Hologenom
Die gesamte genetische Information des Wirtsorganismus und seiner assoziierten Organismen (z.B. des Mikrobioms) [1]. 

[1] Bordenstein SR, Theis KR (2015). Host biology in light of the microbiome: ten principles of holobionts and hologenomes. PLoS Biol 13(8). (externer Link, neues Fenster)