Les cultures de plantes de conservatoire sont à la base d'une agriculture suisse performante
Le conservatoire in vitro d'Agroscope est chargé de maintenir plus de 350 variétés de plantes, anciennes ou modernes, de différentes espèces maraîchères, de plantes ornementales, médicinales et aromatiques, d'essences forestières, d'arboriculture fruitière, de petits fruits, ou encore de vigne. Ces variétés lui sont généralement confiées par des institutions de protection de la biodiversité, mais aussi par des producteurs et sélectionneurs privés. Le conservatoire a également pour tâche de fournir, sur demande, du matériel initial sain pour la multiplication avant la production à grande échelle. Afin d'assurer la traçabilité de ce matériel végétal, un suivi par identification moléculaire est mis en place pour protéger le consommateur.
Les anciennes variétés sélectionnées dans le cadre du Plan d'action national pour la conservation et l'utilisation durable des ressources phytogénétiques pour l'alimentation et l'agriculture (PAN) sont aussi maintenues au conservatoire, après assainissement. En effet, la plupart de ces anciennes accessions sont arrivées infestées par des virus.
Dans le cadre de la certification de la vigne, les plants de base des cépages homologués sont conservés dans une serre protégée des insectes, vecteurs de nombreux virus. Certains cépages sont aussi conservés in vitro. L'établissement de leurs profils génétiques est en cours ainsi que la comparaison avec ceux stockés dans deux bases de données contenant les profils génétiques des cépages européens (Swiss Vitis Microsatellite Database et European Vitis Database).
Actuellement, une centaine d'anciennes variétés de petits fruits (framboises, mûres et fraises) sont conservées in vitro et caractérisées génétiquement dans le cadre du PAN. Les profils génétiques obtenus sont collectés dans deux bases de données (Rubus pour les framboises et les mûres et Fragaria pour les fraises).
L'artémisinine, produite naturellement par Artemisia annua, est une des rares molécules utilisées comme médicament contre la malaria. Des isolats de plantes provenant de diverses parties du monde ont montré toutes ne produisaient pas les mêmes quantités d'artémisinine. Des programmes de croisement et de sélection ayant pour but d'obtenir des plantes à haute teneur en artémisinine ont été initiés par Médiplant et l'Université de York au Royaume-Uni (Graham et al. 2010). Le conservatoire in vitro d'Agroscope est chargé de maintenir les accessions issues de ces croisements et d'assurer leur identité par une caractérisation génétique.
L'artichaut violet de Plainpalais est arrivé à Genève avec les Huguenots. Redécouverte récemment, cette variété fait l'objet d'un travail de sauvegarde par le Service de la production et du développement agricoles du canton de Genève. L'artichaut est sensible à de nombreux pathogènes. Son installation et sa conservation in vitro permettent de lutter contre les risques d'infection et un approvisionnement rapide en matériel de base de haute qualité sanitaire pour la production. Afin d'assurer l'identité de cette variété, un génotypage a été initié. Cette caractérisation génétique vise à situer une variété suisse, cultivée principalement dans le canton de Genève, au sein des collections étrangères et à démontrer son originalité, justifiant ainsi l'attribution à cette variété d'un label de qualité de type AOC, AOP ou Produit du Terroir.
Le kit Agrobox 4000 AP a été mis au point par Agroscope pour optimiser la production in vitro de microtubercules de pommes de terre. Agrobox 4000 AP
Accession Echantillon d’une variété connue ou non. Une variété peut comprendre plusieurs accessions.
Microsatellites
Zones de l’ADN contenant des répétitions de nucléotides. Ces zones sont sujettes à beaucoup de variations d’unevariété à l’autre. On parle alors de marqueurs moléculaires.
Génotypage
Caractérisation d’accessions au moyen de marqueurs moléculaires. Dans les cas mentionnés ici, les marqueurs sont des micro-satellites.
Profil génétique
Résultat du génotypage. Ensemble des données obtenues par micro-satellites pour une accession.
