Pour le développement de la politique agricole, il est important de connaître l'impact de l'agriculture sur l'environnement. C'est pourquoi l'Office fédéral de l'agriculture (OFAG) et Agroscope, sur la base de l'"Ordonnance sur l'évaluation de la durabilité de l'agriculture" (RS 919.118), réalisent un monitoring agro-environnemental. Celui-ci met l’accent sur les pratiques et les processus agricoles (p. ex. applications de produits phytosanitaires), tandis que d'autres programmes de monitoring mesurent la pollution réelle de l'environnement (p. ex. mesure des métabolites dans les eaux souterraines). Le monitoring agro-environnemental porte sur les éléments nutritifs, le sol, l'énergie, le climat, l'eau et la biodiversité. Ses résultats permettent de vérifier les objectifs politiques tels que les trajectoires de réduction des éléments nutritifs et des produits phytosanitaires. Des indicateurs nationaux, basés principalement sur des statistiques nationales, ainsi que des indicateurs régionaux, basés principalement sur des données spécifiques à l'exploitation sont calculés. Le monitoring du système agro-environnemental suisse (MAUS) est notamment responsable de ces derniers. MAUS rassemble et relie de nombreuses sources de données existantes, par exemple les données AGIS et HODUFLU de l'OFAG, les données d'utilisation géoréférencées des cantons et les données relatives au rendement de différentes associations. Des données qui n'existent pas déjà ailleurs et qui ne sont pas accessibles sont collectées selon trois méthodes différentes: 1) des données des systèmes d'information sur la gestion des exploitations agricoles peuvent être envoyées à Agroscope sur une base volontaire au moyen de modules spécialement programmés à cet effet; 2) des informations importantes sont obtenues à partir de données satellites au moyen d'algorithmes (p. ex. couverture du sol); 3) des données pertinentes concernant l'ensemble de l'exploitation sont collectées au moyen d'enquêtes en ligne. Les résultats de MAUS peuvent également être utilisés, dans une mesure limitée, pour évaluer l'impact environnemental de scénarios du système agricole (p. ex. modification du cheptel).