Die Sammlungen von Mikroorganismen von Agroscope - ein unsichtbarer Schatz
Agroscope beherbergt wahre Schätze in Form von wertvollen Mikroorganismen-Sammlungen von Pilzen über Mikroalgen bis zu Bakterien von Käsekulturen: Mikroorganismen treiben als wertvolle Ressource die Forschung zugunsten einer nachhaltigeren Landwirtschaft voran.
In Ökosystemen aller Arten sind Mikroorganismen zentrale Akteure. Entsprechend nehmen sie bei vielen Forschungsthemen von Agroscope eine zentrale Stellung ein. In der Landwirtschaft sind sie beispielsweise für die Bodenqualität, die Pflanzengesundheit und die Produktivität der Kulturen unerlässlich. Überdies werden sie im Rahmen von Verfahren wie Kompostierung oder Biogasproduktion, aber auch in der biologischen Schädlingsbekämpfung gezielt genutzt. In der Lebensmittelindustrie werden mit Mikroorganismen Produkte hergestellt, die wir täglich konsumieren, wie Joghurt, Käse, Wein, Bier, Kimchi oder Schokolade.
Pilze, Algen & Co.: die Mikroorganismen-Sammlungen von Agroscope
Bei Agroscope sind im Laufe jahrzehntelanger Forschung verschiedene Sammlungen entstanden, die eine grosse Vielfalt an Mikroorganismen aus unterschiedlichsten Umgebungen bergen. Einige Beispiele:
- Über einen Zeitraum von mehr als fünfzig Jahren hat die Gruppe Mykologie von Agroscope die umfangreiche Pilzsammlung Mycoscope aufgebaut. Heute umfasst diese Sammlung fast 4400 Stämme. Sie wird genutzt, um nach neuen natürlichen chemischen Verbindungen wie Fungiziden und Medikamenten, Aromen und Farbstoffen zu suchen und um Strategien zur biologischen Bekämpfung von Pflanzenpathogenen zu entwickeln.
- Die Mikroalgensammlung AlgoScope ist eine junge Sammlung. Sie wurde 2022 im Rahmen des Projekts Algafeed ins Leben gerufen, bei dem nach geeigneten einheimischen Mikroalgen als alternative Proteinquelle zu Soja für die Tierernährung gesucht wird. Die interessantesten Stämme der Sammlung finden Eingang in die Entwicklung von Lebens- und Futtermitteln, und in Zukunft könnten sie bei der Forschung über Anwendungen in Bereichen wie Bioremediation, Biokraftstoffe, natürliche Biozide oder Förderung des Pflanzenwachstums zum Einsatz kommen.
- Im Rahmen von Arbeiten zu den Mikroorganismen in Milch und Milchprodukten entstand bei Agroscope auch eine Sammlung von Mikroorganismen aus fermentierten Lebensmitteln. Sie enthält hauptsächlich Bakterien, die aus fermentierten Milchprodukten isoliert wurden. Hinzu kommen Isolate aus anderen fermentierten Lebensmitteln (wie Fleisch oder fermentierte pflanzliche Produkte), eine Sammlung von Bakteriophagen und von Weinhefen sowie Referenzstämme aus internationalen Sammlungen. Die Stämme dieser Sammlung finden unterschiedlichste Anwendungen in der Forschung. Ausserdem enthalten die Käsekulturen, auf denen der Erfolg vieler Schweizer Käsereien beruht, Isolate aus dieser Sammlung.
Eine wichtige Ressource für die aktuelle und künftige Forschung
Die oben genannten Beispiele sind nur eine Auswahl der von Agroscope unterhaltenen umfangreichen Ressourcen. Genauso erwähnenswert sind die Sammlung entomopathogener Pilze für die Forschung im Bereich der biologischen Schädlingsbekämpfung oder die Sammlungen von pathogenen Bakterien der Honigbiene und von humanpathogenen Bakterien einschliesslich antibiotikaresistenter Stämme. Ebenfalls von grossem Interesse sind die Sammlungen von Pilzen, Viren und Bakterien, die als Erreger von Pflanzenkrankheiten Kulturen befallen können. Schliesslich verfügt Agroscope auch über eine Sammlung von Bodenmikroorganismen, die für die Erforschung der Gesundheit und Biodiversität des Bodens wertvoll sind.
Agroscope erkannte frühzeitig den Wert solcher Sammlungen für Forschungsaktivitäten und unterstützte die damit verbundenen umfangreichen Arbeiten, insbesondere durch die Vernetzung der Sammlungen zur Förderung der wissenschaftlichen Zusammenarbeit. Die interaktive Datenbank der Pilzsammlung (www.mycoscope.ch) erleichtert den Forschenden die Nutzung dieser wertvollen Ressourcen.
Diese Sammlungen bieten der wissenschaftlichen Forschung einen einzigartigen Zugang zur mikrobiellen Biodiversität, die genauso wie die Vielfalt des Tier- und Pflanzenreichs durch Umweltveränderungen bedroht ist. Sie sind nicht nur ein wertvolles Erbe der Vielfalt der Mikroorganismen der Schweiz, sondern auch eine Ressource von unschätzbarem Wert für die aktuelle und künftige Forschung und damit für die Entwicklung neuer Produkte und Anwendungen.
In der aktuellsten Publikation lädt Agroscope zu einer Reise durch ihre Mikroorganismen-Sammlungen ein, die wahre Schätze der unsichtbaren Biodiversität bergen.
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Genetische Biodiversität, Sammlungen
Im Rahmen seiner vielfältigen Forschungsaktivitäten hat Agroscope zahlreiche Mikroorganismen gesammelt, die aus verschiedenen Agrar- und Lebensmittelsystemen isoliert wurden. Die so im Laufe der Zeit entstandenen mikrobiellen Sammlungen zeichnen sich nicht nur durch eine breite taxonomische Vielfalt, die Viren, Bakterien, Pilze, Oomyzeten und Mikroalgen umfasst, sondern auch durch eine Vielzahl von Funktionen aus. Einige dieser Mikroorganismen sind Krankheitserreger von Pflanzen, Tieren oder Menschen, während andere biotechnologische Anwendungen haben, wie z.B. Biokontrolle, Herstellung von Lebensmitteln für Menschen und Futtermitteln für Tiere sowie die Synthese bioaktiver Verbindungen von medizinischem oder agronomischem Interesse. Die gesammelten Mikroorganismen stellen nicht nur ein Erbe der mikrobiellen Biodiversität der Schweiz dar, sondern nehmen auch einen zentralen Platz in zahlreichen von Agroscope durchgeführten Forschungsprojekten ein.
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