The DigiRhythm Library

digirhythm
Actogramma sulle misurazioni dell’accelerometro su una vacca (in alto a sinistra), rapporto di accoppiamento funzionale, potenza armonica (in alto a destra) e attività media (in basso a sinistra), calcolati e visualizzati con la biblioteca DigiRhythm.

Gli animali presentano attività ritmiche, cosiddette circadiane, che seguono il ciclo diurno-notturno. Il monitoraggio e lo studio di questi ritmi fornisce informazioni sul benessere degli animali. Più questi ritmi sono pronunciati, migliore è il benessere degli animali.

Il calcolo di tali ritmi si basa sul grado dell’accoppiamento funzionale (DFC) determinato dagli spettri di frequenza dell’attività degli animali.

A questo scopo, abbiamo sviluppato una biblioteca R, denominata DigiRhythm, che supporta i ricercatori nel calcolo della ritmicità. Tra le varie funzionalità, questa biblioteca offre numerosi algoritmi e visualizzazioni in rapporto alle seguenti grandezze:

  • grado dell’accoppiamento funzionale
  • potenza armonica
  • attività media
  • indice di ritmicità
  • actogrammi

La biblioteca, scaricabile tramite il link Github, a breve sarà aggiunta al repository CRAN.

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