Les méthodes modernes de diagnostic génétique permettent non seulement l'identification fiable d'organismes importants dans l’agriculture, mais aussi la caractérisation génétique de propriétés essentielles telles que la résistance aux pesticides et aux antibiotiques. Ce projet a pour but de développer de telles méthodes en vue d’une utilisation sur le terrain, ce qui ouvre de nouvelles possibilités pour la protection phytosanitaire moderne.
Les «bons» micro-organismes peuvent favoriser la croissance des plantes et/ou les protéger contre les parasites, servir d'indicateurs de la qualité d'un sol ou participer à la fermentation du lait dans la production fromagère. L'analyse bioinformatique des données est une condition sine qua non pour décrire de façon complète des microbiomes complexes et utiliser de façon ciblée les micro-organismes importants sur le plan fonctionnel.