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Bioinformatiker
Dr.
Teamleiter Mikrobielle Genomik und Bioinformatik
Steering Komitee Bioinformatik Netzwerk Agroscope (Wissenschaftliche Leitung)
Gruppenleiter Bioinformatik und Proteogenomik (SIB, Schweizer Institut für Bioinformatik)
Kompetenzbereich Methodenentwicklung und Analytik (MEA)
Agroscope-ID: 7677 Per E-Mail versenden
Agroscope
Reckenholzstrasse 191
8046 Zürich
Schweiz
Tel. +41 58 46 06114
Analyse von Mikrobiomen und funktionell besonders relevanter Isolate unter dem Leitsatz «Vom Genom zur Funktion»
Portfolio: Bioinformatische Analyse und Integration von Daten die mittels Methoden der funktionellen Genomik (zB Genomsequenzierung, Transkriptom-, Proteom-, Metabolomanalysen) erhoben wurden; Einbezug der vergleichenden Genomik. Mitarbeit in nationalen und internationalen Konsortien (u.a. bei der Kompostmikrobiomanalyse; Identifizierung und Charakterisierung von Biocontrolstämmen zur Reduktion Einsatz Pflanzenschutzmittel sowie Förderung Pflanzenwachstum). Synergie mit Drittmittelforschung: Entwicklung integrierter Systeme zur Erforschung von Antibiotikaresistenz und Biofilmbildung; Entwicklung von Methoden zu verbesserten Genomannotation von Prokaryoten; Identifizierung neuer Biokontrollgene und antimikrobiell wirkender Peptide.
Thematischer Fokus: Prokaryoten, Biokontrolle, Plant growth promotion, Interaktion Pflanzen-Mikroorganismen, fermentierte Lebensmittel, Antibiotikaresistenz und Biofilmbildung
Methodischer Fokus: Assemblierung von Genomen (de novo), Synergie Genomik -Metagenomik, Transkriptomik, Proteomik, intergierte Datenanalyse, Entschlüsselung von Wirkmechanismen
Publikationsverzeichnisse
