Die Forschungsanstalten wirken mit bei einer effizienten und wirksamen Erfüllung der Kontroll- und Vollzugsaufgaben der Landwirtschaftsgesetzgebung sowie bei weiteren, die Landwirtschaft direkt tangierenden Gesetzen. Dabei tragen sie dem Schutz von Bevölkerung und Umwelt, der Verbesserung der Wettbewerbsfähigkeit der landwirtschaftlichen Produkte auf dem Binnenmarkt sowie der Erhaltung der Exportfähigkeit besonders Rechnung und berücksichtigen die national und international gültigen Normen.

Sie sind im Einzelnen für folgende Kontroll- und Vollzugsaufgaben federführend:

1. Prüfung von Pflanzenschutzmitteln
2. Phytosanitäre Massnahmen inkl. Zertifizierung von Obstarten
3. Sortenprüfung
4. Anerkennung von Pflanzgut
5. Kontrolle von Weinen für die Ausfuhr
6. Düngungsrichtlinien für Acker- und Spezialkulturen
7. Erhaltung der genetischen Ressourcen, Genbank

1. Führung des nationalen milchwirtschaftlichen Referenzlabors
2. Futtermittel:
   - Bewilligung und Kontrolle von Produkten
   - Meldung, Zulassung und Registrierung von Produzenten und Inverkehrbringern

1. Chemischer, physikalischer und biologischer Bodenschutz, Schadstoffe im Boden
2. Anerkennung von Saatgut, Sortenprüfung, Sortenschutz im Feldbau/Futterbau
3. Düngungsgrundlagen
4. Düngungsrichtlinien für den Futterbau
5. Gewässerschutz: Nährstoffbilanzen, Stoffeinträge in Gewässer
6. Referenzmethoden und Laboranerkennung für Dünger- und Bodenanalysen
7. Ermittlung der wirtschaftlichen Lage der Landwirtschaft
8. Prüfung von Sicherheitseinrichtungen landwirtschaftlicher Fahrzeuge
9. Baulicher Gewässerschutz in der Landwirtschaft
10. Prüfung von Stalleinrichtungen und Aufstallungssystemen für Nutztiere
11. Emissionsschutz (Geruch) der Nutztierhaltung
12. Qualitätssicherung der Prüfung von Pflanzenschutzspritzen

Die Geschäftsleitung von Agroscope legt die Zuständigkeiten im Einzelnen fest.