La certification génère une réelle plus-value, car les contrôles portent non seulement sur les virus et les phytoplasmes, mais en plus sur un grand nombre d'organismes pathogènes qui entravent la qualité. L'utilisation de matériel végétal certifié est la meilleure garantie d'une qualité durable de la production fruitière. Elle est incontournable pour les producteurs de fruits.

Pour les pépinières, la certification est un complément facultatif au passeport phytosanitaire légalement prescrit.