Ils surveillent le territoire, contrôlent la présence d'organismes de quarantaine et organisent la lutte en cas d'apparition d'un foyer. Ils doivent impérativement être contactés en cas d'observation de symptômes suspects. En outre, ils donnent des conseils phytosanitaires, spécialement au sujet de l'utilisation des produits phytosanitaires homologués et émettent des autorisations spéciales concernant les prestations écologiques requises .

L'Office fédéral compile une liste d'adresses des services phytosanitaires de tous les cantons.

Quelques cantons possèdent leur propre page Internet au sujet de la protection phytosanitaire.