En accord avec les buts de la politique agraire, le Haras national suisse encourage une détention et un élevage de chevaux en Suisse durables, compétitifs et conformes à l'espèce. A cette fin, la recherche orientée vers la pratique et le transfert de connaissances (formation et conseil) occupent un rôle central.

En étroit réseau avec la filière du cheval et des instituts de recherche suisses et étrangers, les spécialistes du Haras national suisse (agronomes, biologistes, vétérinaires, professionnels du cheval, etc.) mènent de nombreux projets de recherche dans les domaines de l'élevage, du comportement et du bien-être, de l'économie et société, de la santé et de la reproduction.

Afin de renforcer les compétences dans le domaine de la médecine équine, la clinique équine du Haras national suisse à Avenches et la faculté Vetsuisse de l'Université de Berne se sont associées pour créer une structure commune, l'Institut suisse de médecine équine, ISME.  

Le Centre de recherches apicoles fait partie de la station de recherche Agroscope Liebefeld-Posieux ALP à Berne-Liebefeld. Dans le contexte de la recherche agronomique de la Confédération, il travaille en faveur des besoins des apiculteurs-trices. Il élabore des bases techniques et scientifiques et les diffuse dans la pratique et auprès des milieux intéressés.