Sur la base de plusieurs centaines d’études, Agroscope a évalué l’influence des activités agricoles (p. ex. nombre de coupes, application de différents produits phytosanitaires, présence d’éléments structurels écologiques tels que murs de pierre sèche) sur ces groupes d’espèces indicatrices. Cette influence est représentée par la valeur R, où R est compris entre 1 (l’activité a un effet clairement préjudiciable sur la biodiversité) et 5 (l’activité favorise la biodiversité). La note de l’option de gestion Nopt est ensuite calculée pour chaque groupe d’espèces indicatrices au moyen de la formule suivante:
Nopt=R*(CManagement+CHabitat)/2
En général, plus la note Nopt est haute, plus le potentiel pour la biodiversité est élevée. CManagement varie entre 0 et 10 et quantifie l’importance de l’activité pour chaque groupe d’espèces indicatrices. CHabitat s’exprime également en valeurs de 0 à 10 et tient compte de l’importance de l’habitat pour chaque groupe d’espèces indicatrices. La note finale pour un groupe d’espèces indicatrices et pour une grande culture ou un herbage donnée (Nend) est ensuite calculée en faisant la moyenne Nopt de toutes les mesures de gestion. En ce qui concerne les amphibiens, les gastéropodes, les araignées, les carabes, les papillons diurnes et les orthoptères, Nend est également calculée pour les espèces qui n’ont été observées que dans quelques biotopes particuliers (p. ex. espèces de la liste rouge). Pour les différents groupes d’espèces indicatrices, au total 17 indicateurs sont ainsi calculés.
Ensuite les différentes Nend sont regroupées afin de permettre une évaluation globale de la biodiversité (points BD), où chaque Nend est pondérée. Plus un groupe d’espèces indicatrices est important comme source de nourriture pour d’autres groupes et plus il est riche en espèces dans les surfaces agricoles, plus sa pondération est élevée. Les points BD peuvent également être calculés pour l’ensemble de l’exploitation plutôt que par grande culture ou par herbage. On admet que l’influence des différents points BD est proportionnelle à la superficie.
L’exemple des papillons diurnes sur une prairie permanente permet d’illustrer la méthode: un nombre important de coupes (utilisation intensive) obtient une valeur R basse (R=1), car la pratique se répercute négativement sur la diversité des papillons. Ce R bas est également fortement pondéré, car CHabitat et CManagement sont relativement élevés: les prairies permanentes sont un habitat important pour les papillons diurnes (CHabitat=7); de plus, comparé aux autres options de gestion, le nombre de coupes a une grande influence sur les papillons (CManagement=7). Les papillons diurnes jouent un rôle important dans la chaîne alimentaire et la diversité d’espèces est généralement élevée. Un R bas, lié à un nombre important de coupes, se répercute donc assez fortement sur le calcul des points BD.